(一)办公室。主要职责:负责档案馆综合协调日常工作。负责党的建设、妇女、工会、机构编制、人事管理、社会保障和离退休人员的管理服务工作;负责财务、国有资产管理、行政接待、后勤保障工作;负责信息、宣传、文秘、档案、机要、保密、政府信息公开工作;负责重要事项督查督办、绩效目标管理工作;负责综合文字材料起草、综合性会议组织、协调工作;负责联系村、社会治安综合治理、爱国卫生、报刊订阅工作;负责信访、应急、安全保卫、值班等日常工作;承办市委、市政府和上级部门部署的日常工作;
(二)接收保管科。主要职责:负责档案的征集、接收、保管、保护、鉴定、销毁和保密工作。负责市直单位档案资料的接收;负责社会散存、有重要价值档案资料的征集、整理工作;负责馆际间档案资料交流工作;负责全市重要会议、重大活动、重要事件档案资料征集工作;负责馆藏档案资料整理、保管、统计工作;负责馆藏档案的开放鉴定和涉密档案的解密划控工作;负责《档案馆指南》、全宗名册及各类检索工具的编制工作;负责馆藏到期档案的鉴定销毁工作;负责库房日常管理、安全防护措施和防护设备的管理维护工作;负责重要、珍贵和利用频繁档案资料的复制工作;负责破损、褪变重要档案资料的抢救、修复工作;
(三)查阅利用科。主要职责:负责接收、整理市委、市政府和市直机关、事业单位报送的政府信息公开文件并面向社会提供查阅和利用;负责馆藏档案利用方面的咨询服务,并向来馆查阅档案的单位或个人提供己公开档案资料的查阅利用服务;负责查阅利用档案的调卷、还卷工作。
(四)编辑研究科。主要职责:负责馆藏档案资源的开发利用工作。负责档案文献资料、著作、刊物的出版发行工作;负责档案文史调研和重要历史课题研究工作;负责有关部门组织的编史修志及书报刊物的供稿工作;负责承办历史展览、文献纪录片等的对外宣传活动;负责档案文化用品的开发工作;负责荣成历史档案资料及文化遗产搜集抢救工作;负责档案文化交流工作;负责外文档案的翻译整理工作。
(五)信息技术科。主要职责:负责全市档案信息化建设工作。负责馆藏档案数字化工作;负责数字档案馆的建设、维护工作;负责档案数字化管理平台建设、管理工作;负责市直单位文件材料、电子文件的接收、管理和归档指导服务工作;负责馆藏电子档案数据的管理和容灾备份工作;负责电子政务网和办公软件系统、硬件设备的管理、维护工作。